IRUD research achievements

Number of analyses and results
(past 9 years / as of Sep 2025)

1) Number of whole exome sequencing (WES) analysis requests to IRUD

Number of samples
(individuals)
29325
Number of families
(propositus)
10304
Number of families analyzed (A)
8335

2) Breakdown of analyzed families (A)

Families analyzed (A)
8335
 
[ Breakdown ]
Unconfirmed diagnoses
4203
Of these, 356 families have a suspected new disease (N of 1)*
* N of 1: A candidate disease gene has been identified, but the finding is based on only one family, so it cannot be confirmed.
Confirmed diagnoses
4132(B)
Of these, 50 families have a newly identified disease.

3) Breakdown of confirmed diagnoses (B) (as of March 2025)

Breakdown of confirmed diagnoses (B)
Number of IRUD diagnoses related to Orphanet-listed genes
Number of causative genes for the 333 designated intractable diseases: 1642
(excluding mitochondrial disease genes)
379
Number of disease-causing genes for rare intractable diseases listed in Orphanet: 4128
(excluding mitochondrial disease genes)
630
Number of disease-causing genes for rare intractable diseases listed in Orphanet,
excluding causative genes for Japan’s designated: 1770
335

実績

主な新規原因遺伝子の発見(2020年5月8日現在 publish されたもの)

疾患
担当解析センター
遺伝子
文献
無巨核球性血小板減少症を伴う橈尺骨癒合症
東北大学
(IRUDの業績として公表)
EVI1
Niihori T et al. Am J Hum Genet. 2015;97(6):848-54
Hydranencephaly-like severe form of cortical dysgenesis
慶應義塾大学
(IRUDの業績として公表)
TUBA1A
Yokoi S et al. Sci Rep 2015;5:15165
Schimmelpenning-Feuerstein-Mims 症候群
東北大学
(IRUDの業績として公表)
BRAF
Watanabe Y et al. Am J Med Genet A. 2016 Jan;170A(1):189-94.
Intellectual disability with seizures and hypotonia
横浜市立大学
(IRUDの業績として公表)
PIGG
Makrythanasis P et al. Am J Hum Genet 2016: 98: 615-626.
Overlap with Coffin–Siris Syndrome
横浜市立大学
SMARCA2
Miyake N et al., Am J Med Genet A.2016 170(10):2662-2670
West syndrome
横浜市立大学
(IRUDの業績として公表・既知遺伝子の新たな表現型)
WDR45
Nakashima M et al. J. Hum Genet.2016 61(7):653-661
Pontocerebellar hypoplasia
横浜市立大学
TOE1
Lardelli RM et al. Nat Genet. 2017 49(3):457-464
Bosma arhinia microphthalmia syndrome
国立成育医療研究センター・長崎大学
(IRUDの業績として公表)
SMCHD1
Shaw ND et al. Nat Genet. 2017 Feb; 49(2): 238-248.
難治性てんかんと多発奇形症候群の異なる2疾患(異なる変異部位で別々に発症)
横浜市立大学
(既知遺伝子の新たな表現型)
PPP3CA
Mizuguchi T et al. Hum Mol Genet. 2018 Apr 15;27(8):1421-1433
ステロイドに反応を示す一次性ネフローゼ症候群(指定難病222)
東北大学
(日本からは1家系(ITSN2:新規))
ITSN1, ITSN2, DLC1, MAGL2, CDK20, TNS2
Ashraf S, Kudo H et al., Nat Commun 2018;9(1):1960
新規ガラクトース血症(type IV galactosemia)
東北大学
GALM
Wada et al., Genet Med. (in press)
痙性対麻痺、知的障害、脳形成異常を持つ新規奇形症候群
東北大小児科・成育医療研究センター、横浜市大および東北大学際研(IRUD-beyond)の共同研究
MAPK8IP3
Iwasawa S et al. Ann Neurol. 2019 Jun;85(6):927-933
West Syndrome
横浜市立大学(既知遺伝子の新たな表現型)
FGF12重複
Oda Y et al.  J Hum Genet. 2019 Oct;64(10):1005-1014
Noonan症候群
横浜市立大学、東北大学とのマッチング
RRAS2
Niihori T et al. Am J Hum Genet. 2019 Jun 6;104(6):1233-1240
知的障害を伴う乳幼児てんかん
慶應義塾大学,IRUD-Exchangeでマッチング、IRUD-Beyondで確定 (IRUDの業績として公表)
NSF
Suzuki H et al, Ann Clin Transl Neurol. 2019 Nov;6(11):2334-2339
知的障害を伴う特異顔貌
慶應義塾大学
CNOT2
Uehara T et al, Am J Med Genet A. 2019 Dec;179(12):2506-2509
肝内胆汁鬱滞
慶應義塾大学
LSR
Uehara T et al, J Pediatr. 2020 Apr 14. pii: S0022-3476(20)30137-2
知的障害、てんかん、自閉症
成育医療研究センター、浜松医科大学
SETD1B
Hiraide T et. al 2018 Hum Genet. 137(1):95-104.
Cole-Carpenter Syndrome
成育医療研究センター(既知遺伝子の新たな表現型)
SEC24D
Takeyari S et. al. 2018 Am J Med Genet A. 176(12):2882-2886
Severe apnea and sick sinus syndrome
成育医療研究センター(既知遺伝子の新たな表現型)
MECP2
Shioda T et. Al. 2018 Brain Dev.40(8):714-71
Early childhood-onset type 1B diabetes
成育医療研究センター、浜松医科大学(既知遺伝子の新たな表現型)
KLF11
Ushijima K et. al. 2019 Pediatr Diabetes. 20(6):712-719
Global developmental delay with seizures
成育医療研究センター、浜松医科大学(既知遺伝子の新たな表現型)
CSNK2A1 and CSNK2B
Nakashima M et. al. 2019 J Hum Genet. 64(4):313-322
OFD syndrome
慶應義塾大学(既知遺伝子の新たな表現型)
IFT172
Yamada M et al. Am J Med Genet A. 2019 Dec;179(12):2510-2513.

未診断患者における新規疾患概念の確立

疾患
担当解析センター
原因遺伝子/変異・疾患概念
Takenouchi-Kosaki syndrome
慶應義塾大学
(IRUDの業績として公表)
巨大血小板減少症と精神遅滞症候群のphenotypeおよびCDC42のgenotypeをもつ複数の家系を見いだし、新規疾患として報告した。(Takenouchi T. Et al. Am J Med Genet, 2015; 167A: 2822-2825)
Kosaki Overgrowth syndrome
慶應義塾大学
(IRUDの業績として公表・既知遺伝子の新たな表現型)
過成長・骨格異常・薄い皮膚・退行を主徴とし、PDGFRB機能獲得性変異により発症する新規症候群を発見した。(Am J Med Genet A, 2017 Sep; 173(9): 2422-242)
ZTTK syndrome/Braddock-Carey syndrome
慶應義塾大学
(IRUDの業績として公表)
SON遺伝子変異による、認知障害や発達遅延、大脳皮質の奇形、てんかん、視覚障害、骨格筋異常、先天性奇形などを特徴とする認知障害症候群(Takenouchi T et al, Am. J. Med. Genet. 170A: 2587-2590, 2016)
Gabriele-de Vries syndrome
慶應義塾大学
YY1遺伝子による、精神運動遅滞、認知障害、摂食障害、顔異形などを特徴とする症候群(Gabriele M et al., Am J Hum Genet. 2017 Jun 1;100(6):907-925)